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張和平團(tuán)隊(duì)建成了全球最大乳酸菌種質(zhì)庫(kù)

   2023-10-26 內(nèi)蒙古自治區(qū)科技廳
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核心提示:近日,內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授張和平團(tuán)隊(duì)在《Science Bulletin》(《科學(xué)通

近日,內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)乳品生物技術(shù)與工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授張和平團(tuán)隊(duì)在《Science Bulletin》(《科學(xué)通報(bào)》)發(fā)表了題為“The iLABdb: a web-based integrated lactic acid bacteria database”的文章,發(fā)布了基于Web的綜合乳酸菌基因組數(shù)據(jù)庫(kù)——iLABdb(https://www.imhpc.com/iLABdb),建成了全球最大的乳酸菌基因組、功能研究數(shù)據(jù)共享數(shù)據(jù)庫(kù)和平臺(tái)iLABdb。張和平教授為該文的通訊作者,內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)在站博士后靳昊、博士研究生馬騰、海南大學(xué)陳琳為共同第一作者。

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乳酸菌作為微生物領(lǐng)域重要戰(zhàn)略資源,已在食品、工業(yè)、醫(yī)療、健康、農(nóng)業(yè)和生態(tài)保護(hù)等多個(gè)領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。但由于其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的復(fù)雜性以及菌株間功能和代謝的巨大差異性,乳酸菌系統(tǒng)研究和應(yīng)用開(kāi)發(fā)面臨著巨大挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法難以滿足對(duì)乳酸菌深入研究和高效挖掘的需求,限制了乳酸菌開(kāi)發(fā)利用效率。因此,全球?qū)W術(shù)界和產(chǎn)業(yè)界亟需收集并整合乳酸菌遺傳資源,構(gòu)建多樣化乳酸菌種質(zhì)資源庫(kù),借助生物信息學(xué)前沿技術(shù)和先進(jìn)數(shù)據(jù)分析算法,建立高效挖掘乳酸菌資源的數(shù)據(jù)共享平臺(tái),滿足乳酸菌在不同領(lǐng)域研究和應(yīng)用需求,推動(dòng)乳酸菌相關(guān)產(chǎn)業(yè)進(jìn)一步發(fā)展。

張和平團(tuán)隊(duì)歷時(shí)三十余載,建成全球最大、種類最全的原創(chuàng)性乳酸菌種質(zhì)資源庫(kù),分離保藏乳酸菌4.7萬(wàn)余株,為乳酸菌研究和利用提供了不可或缺的珍貴資源。該數(shù)據(jù)庫(kù)不僅整合了超過(guò)62000個(gè)乳酸菌基因組及相關(guān)元數(shù)據(jù)信息,還提供了關(guān)于乳酸菌序列分析、可視化和數(shù)據(jù)共享工具,收錄了益生乳酸菌臨床干預(yù)研究文獻(xiàn)。據(jù)張和平教授介紹,團(tuán)隊(duì)計(jì)劃擴(kuò)大數(shù)據(jù)的覆蓋范圍,納入更多的乳酸菌相關(guān)基因組和與健康相關(guān)的臨床研究數(shù)據(jù),到今年年底完成2萬(wàn)株,2024年達(dá)成3萬(wàn)株乳酸菌分離株的基因組測(cè)序工作,提前達(dá)成“萬(wàn)株乳酸菌基因組計(jì)劃”既定量級(jí)目標(biāo)。隨著乳酸菌資源的深度開(kāi)發(fā)和應(yīng)用以及不斷擴(kuò)充與完善,iLABdb 2.0版將實(shí)現(xiàn)對(duì)乳酸菌遺傳特性、遺傳潛力和進(jìn)化溯源的深入分析,3.0版將基于人工智能實(shí)現(xiàn)更廣泛、更深入、更聚焦的乳酸菌功能預(yù)測(cè)。

乳酸菌作為與人類文明緊密相連的微生物,其深入研究與應(yīng)用開(kāi)發(fā)對(duì)推動(dòng)相關(guān)產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新發(fā)展具有巨大價(jià)值。該重大成果的發(fā)布,為全球乳酸菌研究與產(chǎn)業(yè)進(jìn)步開(kāi)啟了新篇章,標(biāo)志著我國(guó)在這一領(lǐng)域的研究邁向了新的里程碑。iLABdb數(shù)據(jù)庫(kù)有助于研究人員更準(zhǔn)確地識(shí)別菌株遺傳背景,直觀地探索乳酸菌基因組中關(guān)鍵功能區(qū)域,高效地分析乳酸菌功能特性和潛在應(yīng)用價(jià)值,并為國(guó)內(nèi)外乳酸菌研究機(jī)構(gòu)和企業(yè)提供合作交流重要平臺(tái),不斷促進(jìn)國(guó)際技術(shù)交流合作,推動(dòng)乳酸菌相關(guān)產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新和可持續(xù)發(fā)展。


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