近日,內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝與植物保護(hù)學(xué)院植物病毒實(shí)驗(yàn)室趙明敏教授實(shí)驗(yàn)室在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《分子植物病理學(xué)》(Molecular Plant Pathology)上發(fā)表題為“AlkB-RNA脫甲基酶同系物和N6腺苷酸甲基化參與馬鈴薯Y病毒感染”(AlkB RNA demethylase homologues and N6-methyladenosine are involved in Potyvirus infection)的論文。此項(xiàng)研究工作得到了國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金地區(qū)基金項(xiàng)目、內(nèi)蒙古自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目的資助。同時(shí),也得到了內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)高層次人才科研啟動(dòng)基金項(xiàng)目的支持。
VIGS株系中PPV和PVY的病
N6腺苷酸甲基化(N6-methyladenosine,m6A)修飾是迄今已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的100余種RNA甲基化修飾中最普遍存在的一種,大量存在于信使RNA(mRNA)和長(zhǎng)的非編碼RNA(lncRNA)中,在酵母、植物、哺乳動(dòng)物和病毒等物種之間是高度保守的,其功能可能參與mRNA剪接、運(yùn)輸?shù)燃庸み^(guò)程。近年來(lái),已成為生命科學(xué)領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。隨著對(duì)m6A甲基化研究的不斷深入,人們發(fā)現(xiàn)M6A甲基化在細(xì)胞內(nèi)是一個(gè)動(dòng)態(tài)可逆的過(guò)程,主要受到甲基轉(zhuǎn)移酶(METTL3,METTL14,WTAP等),去甲基化酶(FTO,ALKBH5等)以及一些RNA特性結(jié)合蛋白(YTHDF1/2/3, ELAVL1等)的共同調(diào)控。
關(guān)于人類病毒m6A甲基化的研究證實(shí)了m6A甲基化在病毒復(fù)制侵染中具有重要的生物學(xué)意義。在植物病毒研究領(lǐng)域相關(guān)m6A甲基化修飾的報(bào)道較少。已發(fā)現(xiàn)有些植物病毒中含有ALKB蛋白同源物或結(jié)構(gòu)域。例如,彎曲病毒科(Flexiviridae)的成員,包括葡萄病毒A(Grapevine virus A,GVA),藍(lán)莓焦燒病毒(Blueberry scorch virus , BlScV) 和黑莓病毒Y(Blackberry virus Y, BVY)和一個(gè)馬鈴薯Y病毒(Potyviridae)科中未命名的新屬中含有ALKB類似結(jié)構(gòu)域。序列分析表明ALKB結(jié)構(gòu)域可能參與修復(fù)由甲基化造成的RNA損傷,在清除有害RNA的病毒基因組,維持病毒RNA的穩(wěn)定性中發(fā)揮著重要作用。
推測(cè)植物病毒編碼ALKB結(jié)構(gòu)域可能由于病毒與寄主植物互作過(guò)程中長(zhǎng)期進(jìn)化的結(jié)果,病毒通過(guò)自身編碼的ALKB實(shí)現(xiàn)其基因組RNA的脫甲基化,有利于被包裹到病毒粒子中,促進(jìn)病毒復(fù)制和侵染。內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)植物病毒實(shí)驗(yàn)室針對(duì)m6A甲基化修飾及其AlkB蛋白調(diào)控馬鈴薯Y病毒屬病毒侵染進(jìn)行了深入研究。
基于MeRIP-seq技術(shù)的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)馬鈴薯Y病毒屬病毒侵染后寄主植物內(nèi)源m6A甲基化水平明顯降低,m6A甲基化修飾峰集中在植物內(nèi)源基因轉(zhuǎn)錄本的3'非翻譯區(qū)。同時(shí)病毒基因組本身的mRNA也可被m6A甲基化修飾。沉默本氏煙AlkB基因(植物特異性去甲基化酶ALKBH9的同源物)后,導(dǎo)致PVY和PPV病毒含量明顯降低。關(guān)于m6A甲基化的進(jìn)化研究,以及AlkB同源物對(duì)病毒侵染的影響證明了m6A甲基化在馬鈴薯病毒侵染中的調(diào)控作用。研究結(jié)果有助于揭示植物RNA病毒與寄主互作的表觀遺傳學(xué)調(diào)控新機(jī)制,為馬鈴薯病毒病的防治策略研發(fā)提供新切入點(diǎn)。
植物病毒實(shí)驗(yàn)室還在國(guó)際期刊Biology上發(fā)表了題為“The reversible methylation of m6A is involved in plant virus infection”的綜述論文。論述了在植物病毒侵染中m6A甲基化具有的重要調(diào)控作用。一方面,植物病毒侵染能夠誘發(fā)寄主植物的m6A甲基化,產(chǎn)生相應(yīng)的免疫反應(yīng)從而抑制病毒復(fù)制,或者通過(guò)對(duì)病毒基因組mRNA進(jìn)行m6A甲基化修飾在翻譯水平上影響病毒侵染。另一方面,植物病毒可通過(guò)與m6A甲基化相關(guān)蛋白的互作打破寄主植物m6A甲基化的可逆修飾平衡,從而抑制或逃避m6A甲基化修飾。
論文鏈接:
https://doi.org/10.1111/mpp.13239
https://www.mdpi.com/2079-7737/11/2/271
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