單細(xì)胞多組學(xué),尤其是染色質(zhì)可及性表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄組同時測序分析,不僅可以鑒別細(xì)胞類型和狀態(tài),還可以揭示控制基因表達(dá)的機理,被視為單細(xì)胞組學(xué)分析的極致利器。而隨著空間組學(xué)的興起,空間多組學(xué)技術(shù)(spatial multi-omics)是否可以同時分析基因表達(dá)和基因調(diào)控機制,已成為全球矚目熱點,還曾被《Nature》雜志展望為2022年最值得期待的七項技術(shù)之一。
近期,美國耶魯大學(xué)和瑞典卡羅林斯卡學(xué)院的研究團隊開發(fā)了一項最新的空間多組學(xué)技術(shù),成功實現(xiàn)了同一組織樣本上總體染色質(zhì)可及性和基因表達(dá)的聯(lián)合空間組學(xué)分析(Spatial ATAC-RNA-seq),并同時報道了三種特定組蛋白修飾和基因表達(dá)的聯(lián)合分析(Spatial CUT&Tag-RNA-seq)。與單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合分析顯示,這些技術(shù)達(dá)到了細(xì)胞水平或接近單細(xì)胞分辨率。該團隊希望后續(xù)將該技術(shù)應(yīng)用于各種組織類型,并生成表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄狀態(tài)的空間圖譜,以空間和全基因組水平為視角,深入探尋表觀遺傳機制在組織內(nèi)掌控轉(zhuǎn)錄表型和細(xì)胞動態(tài)的奧秘。相關(guān)研究結(jié)果于2023年3月15日以“Spatial epigenome-transcriptome co-profiling of mammalian tissues”為題發(fā)表在《Nature》雜志上。
注:此研究成果摘自《Nature》,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場。