近日,美國佐治亞大學(xué)的研究人員在Nature Plants上發(fā)表了題為“The prevalence, evolution and chromatin signatures of plant regulatory elements”的文章,對(duì)植物調(diào)控因子的普遍性、進(jìn)化和染色質(zhì)特征進(jìn)行了較深入的研究。
染色質(zhì)的可及性和修飾是調(diào)控DNA的標(biāo)志之一,科研人員在對(duì)其的研究中發(fā)現(xiàn)了順式調(diào)控元件(cis-regulatory elements, CREs)。在本研究中,科研人員研究了13種植物的染色質(zhì)可及性、組蛋白修飾和序列保守性,鑒定出數(shù)千個(gè)假定CREs,發(fā)現(xiàn)遠(yuǎn)端CREs(distal CREs)在植物中普遍存在,特別是在具有大型和復(fù)雜基因組的物種中。大多數(shù)遠(yuǎn)端CREs通過轉(zhuǎn)座因子(transposable-element, TE)的增殖而遠(yuǎn)離其靶基因,也有大量遠(yuǎn)端CREs似乎也由TEs產(chǎn)生。最后,植物遠(yuǎn)端CREs與三種不同于后生動(dòng)物的染色質(zhì)特征相關(guān)聯(lián)。綜上所述,這些結(jié)果表明CREs在植物中普遍存在,在進(jìn)化過程中高度動(dòng)態(tài),并通過不同的染色質(zhì)途徑調(diào)節(jié)基因表達(dá)。(摘譯自Nature Plants, Published: 18 November 2019)
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