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Nature Plants: 玉米基因組中廣泛存在遠(yuǎn)距離順式調(diào)控元件

   2019-12-19 互聯(lián)網(wǎng)綜合消息
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核心提示:  近日,美國(guó)佐治亞大學(xué)等科研機(jī)構(gòu)的研究人員在Nature Plants上發(fā)表了題為“Widespread long-range cis-r

  近日,美國(guó)佐治亞大學(xué)等科研機(jī)構(gòu)的研究人員在Nature Plants上發(fā)表了題為“Widespread long-range cis-regulatory elements in the maize genome”的文章,對(duì)玉米基因組中廣泛存在的遠(yuǎn)距離順式調(diào)控元件進(jìn)行了較深入的研究。

  作物遺傳圖譜研究表明,農(nóng)藝性狀可以由基因-遠(yuǎn)端基因間區(qū)位點(diǎn)調(diào)控。盡管這些基因座具有重要的生物學(xué)意義和潛在的農(nóng)藝用途,但迄今為止,尚缺少在所有作物物種中對(duì)這些基因座的深入研究。在本研究中,科研人員提供的遺傳、表觀基因組和功能性分子證據(jù),支持了玉米基因組中廣泛存在的基因-遠(yuǎn)端基因間區(qū)位點(diǎn)可以作為遠(yuǎn)距離轉(zhuǎn)錄順式調(diào)控元件(cis-regulatory elements, CREs)來(lái)發(fā)揮調(diào)控作用。這些位點(diǎn)豐富了常染色質(zhì)特征,表明它們具有調(diào)節(jié)功能,假定的CREs通過(guò)染色質(zhì)環(huán)與基因連接。利用自我轉(zhuǎn)錄活性調(diào)控區(qū)測(cè)序技術(shù)(self-transcribing active regulatory region sequencing,STARR-seq),發(fā)現(xiàn)假定的CREs也顯示了轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子活性的提高。這些結(jié)果為CREs遠(yuǎn)基因距離控制基因表達(dá)提供了功能支持。(摘譯自Nature Plants, Published: 18 November 2019)


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