2019年10月8日,德克薩斯大學(xué)休斯敦健康研究中心的韓冷、李文博課題組合作在Nature Communications上在線發(fā)表題為“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted therapy incancer”的研究。該研究構(gòu)建了迄今為止最完整的癌癥增強(qiáng)子RNA(eRNA)圖譜并揭示了eRNA在癌癥臨床中的潛在應(yīng)用。
該項(xiàng)研究通過(guò)檢測(cè)eRNA在約1萬(wàn)名癌癥病人及約1000個(gè)癌癥細(xì)胞系中的表達(dá)構(gòu)建了目前為止最全面的癌癥eRNA圖譜,揭示了eRNA的癌癥特異性表達(dá)/癌癥種系特異性表達(dá)的特征,同時(shí)強(qiáng)調(diào)了eRNA作為生物標(biāo)記物在不同類型癌癥臨床上的應(yīng)用。通過(guò)研究eRNA與轉(zhuǎn)錄因子之間的共表達(dá)關(guān)系,發(fā)現(xiàn)eRNA的特異性表達(dá)與轉(zhuǎn)錄因子特異性調(diào)控密切相關(guān)。通過(guò)分析eRNA與編碼基因之間的基因組距離及表達(dá)相關(guān)性并結(jié)合多組Hi-C數(shù)據(jù)加以佐證,該研究構(gòu)建了eRNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),揭示了eRNA在調(diào)控致癌信號(hào)通路及調(diào)節(jié)癌癥臨床治療基因中的關(guān)鍵作用。此外,該研究通過(guò)調(diào)查eRNA與抗癌化合物之間的關(guān)系,首次證實(shí)eRNA可影響癌癥細(xì)胞對(duì)抗癌藥物的敏感性和抵抗性,且該影響可能會(huì)關(guān)聯(lián)到相關(guān)的一條或多條癌癥信號(hào)通路。
這項(xiàng)研究拓展了該領(lǐng)域?qū)Π┌Y基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的認(rèn)知,探索了基于靶向eRNA的癌癥治療及聯(lián)合治療方案,開拓了癌癥治療新思路。
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該項(xiàng)研究通過(guò)檢測(cè)eRNA在約1萬(wàn)名癌癥病人及約1000個(gè)癌癥細(xì)胞系中的表達(dá)構(gòu)建了目前為止最全面的癌癥eRNA圖譜,揭示了eRNA的癌癥特異性表達(dá)/癌癥種系特異性表達(dá)的特征,同時(shí)強(qiáng)調(diào)了eRNA作為生物標(biāo)記物在不同類型癌癥臨床上的應(yīng)用。通過(guò)研究eRNA與轉(zhuǎn)錄因子之間的共表達(dá)關(guān)系,發(fā)現(xiàn)eRNA的特異性表達(dá)與轉(zhuǎn)錄因子特異性調(diào)控密切相關(guān)。通過(guò)分析eRNA與編碼基因之間的基因組距離及表達(dá)相關(guān)性并結(jié)合多組Hi-C數(shù)據(jù)加以佐證,該研究構(gòu)建了eRNA的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),揭示了eRNA在調(diào)控致癌信號(hào)通路及調(diào)節(jié)癌癥臨床治療基因中的關(guān)鍵作用。此外,該研究通過(guò)調(diào)查eRNA與抗癌化合物之間的關(guān)系,首次證實(shí)eRNA可影響癌癥細(xì)胞對(duì)抗癌藥物的敏感性和抵抗性,且該影響可能會(huì)關(guān)聯(lián)到相關(guān)的一條或多條癌癥信號(hào)通路。
這項(xiàng)研究拓展了該領(lǐng)域?qū)Π┌Y基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的認(rèn)知,探索了基于靶向eRNA的癌癥治療及聯(lián)合治療方案,開拓了癌癥治療新思路。
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