2019年10月10日,英國女王醫(yī)學研究所N. C.Henderson和P. Ramachandran研究組在Nature上發(fā)表了題為“Resolving the fibrotic niche of human livercirrhosis at single-cell level”長文,對超過100,000個人類肝臟單細胞進行轉錄組研究,在單細胞水平以及分子水平對肝硬化的病理原因進行解析,為肝硬化治療靶點所需的病理方面、分子機制以及細胞層面提供了重要理論依據(jù)。
首先,研究人員將健康與肝硬化人體肝臟細胞進行流式細胞分選并進行單細胞測序,構建了人體肝臟非薄壁細胞的單細胞圖譜,將該單細胞測序數(shù)據(jù)庫共享,以便對于健康人體與肝硬化肝臟細胞中基因表達差異進行比較。
對單細胞測序結果進行聚類分析后發(fā)現(xiàn)纖維化的肝臟細胞中TREM2+CD9+標記的巨噬細胞SAMΦ(1)和SAMΦ(2)數(shù)量增加。這些細胞既具有單核白細胞的特點又具有Kupffer細胞的特點。研究人員發(fā)現(xiàn)增加的SAMΦ巨噬細胞來源于單核細胞,并且在纖維化微環(huán)境中代表著終端分化的細胞狀態(tài)。通過肝臟纖維化的小鼠模型也證實了SAMΦ的存在在物種之間的保守性,在肝臟疾病進展過程中同樣具有預纖維化的特點。
總的來說,Henderson研究組通過使用單細胞測序以及空間上的對于細胞位置進行重構,對人類肝臟纖維化微環(huán)境進行了解析,鑒定出了具有致病性的TREM2+CD9+的巨噬細胞群體,ACKR1+PLVAP+內皮細胞群體以及PDGFRα+的成纖維細胞。而在細胞群類的相互作用組的研究中,鑒定出了與肝臟纖維化極為相關的信號通路,為潛在的醫(yī)療制藥方面提供了可供參考的思路。該工作也進一步證實了單細胞轉錄組學對人體器官纖維化的細胞和分子基礎進行解碼的能力,為發(fā)現(xiàn)相關治療靶標治療廣泛纖維化疾病的患者提供了概念框架。
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首先,研究人員將健康與肝硬化人體肝臟細胞進行流式細胞分選并進行單細胞測序,構建了人體肝臟非薄壁細胞的單細胞圖譜,將該單細胞測序數(shù)據(jù)庫共享,以便對于健康人體與肝硬化肝臟細胞中基因表達差異進行比較。
對單細胞測序結果進行聚類分析后發(fā)現(xiàn)纖維化的肝臟細胞中TREM2+CD9+標記的巨噬細胞SAMΦ(1)和SAMΦ(2)數(shù)量增加。這些細胞既具有單核白細胞的特點又具有Kupffer細胞的特點。研究人員發(fā)現(xiàn)增加的SAMΦ巨噬細胞來源于單核細胞,并且在纖維化微環(huán)境中代表著終端分化的細胞狀態(tài)。通過肝臟纖維化的小鼠模型也證實了SAMΦ的存在在物種之間的保守性,在肝臟疾病進展過程中同樣具有預纖維化的特點。
總的來說,Henderson研究組通過使用單細胞測序以及空間上的對于細胞位置進行重構,對人類肝臟纖維化微環(huán)境進行了解析,鑒定出了具有致病性的TREM2+CD9+的巨噬細胞群體,ACKR1+PLVAP+內皮細胞群體以及PDGFRα+的成纖維細胞。而在細胞群類的相互作用組的研究中,鑒定出了與肝臟纖維化極為相關的信號通路,為潛在的醫(yī)療制藥方面提供了可供參考的思路。該工作也進一步證實了單細胞轉錄組學對人體器官纖維化的細胞和分子基礎進行解碼的能力,為發(fā)現(xiàn)相關治療靶標治療廣泛纖維化疾病的患者提供了概念框架。
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