肺癌是最常見的癌癥類型,發(fā)病機制復雜,具有高度異質(zhì)性,遺傳因素在肺癌發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮重要作用,但其具體遺傳機制尚不清楚。增強子元件是一類特定的DNA序列,其序列富含轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,并具有特異性的表觀遺傳修飾標記,通過形成染色質(zhì)環(huán)高級結(jié)構(gòu)與靶基因啟動子相互作用,實現(xiàn)對靶基因的遠程調(diào)控,是基因組中調(diào)控基因表達的關(guān)鍵元件。增強子遺傳變異可增加個體對特定復雜性疾病的易感性,是多種人類疾病的重要遺傳基礎。
南京醫(yī)科大學孫玉潔教授課題組與沈洪兵教授課題組及宋鑫教授課題組合作,以既往研究發(fā)現(xiàn)的中國人群肺癌風險單核苷酸多態(tài)位點(Single Nucleotide Polymorphism,SNP) rs753955 (A>G)為遺傳標記,通過體內(nèi)外實驗系統(tǒng)探討了染色體13q12.12風險基因座遺傳背后的生物學意義及潛在機制,該研究工作于2019年5月發(fā)表于Genome Biology。
該研究結(jié)果表明,染色體13q12.12風險基因座區(qū)域內(nèi)含有一個p53響應性增強子元件,可通過形成染色質(zhì)環(huán)結(jié)構(gòu)來遠程調(diào)控其靶基因TNFRSF19 的表達水平,有效抑制致癌物誘導的DNA損傷和細胞惡性轉(zhuǎn)化。而染色體13q12.12風險基因座區(qū)域內(nèi) rs17336602(G>C),rs4770489(A>G)和 rs34354770(A>C)三個常見遺傳變異可通過降低該增強子的p53響應性從而導致肺癌風險和疾病發(fā)展。
該研究為解析肺癌的遺傳機制提供了新的依據(jù),同時提示13q-Enh增強子和TNFRSF19可以作為肺癌風險篩查和臨床預后的潛在生物標志物。
原文地址:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1696-1
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