近日,法國巴黎文理研究大學等科研人員在Nature Genetics上發(fā)表了題為“High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer”的文章,利用高通量單細胞ChIP-seq確定了乳腺癌染色質(zhì)狀態(tài)的異質(zhì)性。
組蛋白修飾介導的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)控是主要的表觀遺傳和基因表達調(diào)節(jié)機制。然而,染色質(zhì)特征對腫瘤異質(zhì)性和腫瘤進化的影響尚不清楚。在本研究中,科研人員利用高通量液滴微流體平臺,以單細胞分辨率繪制出數(shù)千個細胞的染色質(zhì)圖譜。利用患者來源對化療和靶向治療獲得性耐藥的乳腺癌的異種移植模型,科研人員發(fā)現(xiàn),在未經(jīng)治療的藥物敏感腫瘤中,一部分細胞與耐藥腫瘤細胞具有相同的染色質(zhì)特征,這一發(fā)現(xiàn)無法通過批量實驗檢測到。這兩類細胞中,均出現(xiàn)染色質(zhì)標記物H3K27me3丟失,H3K27me3與穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄抑制基因有關(guān),已知這些基因可以促進耐藥的發(fā)生。本研究開發(fā)的單細胞染色質(zhì)免疫沉淀后測序的方法為染色質(zhì)異質(zhì)性功能的研究提供了有力工具,可應用于癌癥和其他疾病以及保健的研究,特別是涉及細胞分化和發(fā)育過程的研究。(摘譯自Nature Genetics,Published:31 May 2019)
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組蛋白修飾介導的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的調(diào)控是主要的表觀遺傳和基因表達調(diào)節(jié)機制。然而,染色質(zhì)特征對腫瘤異質(zhì)性和腫瘤進化的影響尚不清楚。在本研究中,科研人員利用高通量液滴微流體平臺,以單細胞分辨率繪制出數(shù)千個細胞的染色質(zhì)圖譜。利用患者來源對化療和靶向治療獲得性耐藥的乳腺癌的異種移植模型,科研人員發(fā)現(xiàn),在未經(jīng)治療的藥物敏感腫瘤中,一部分細胞與耐藥腫瘤細胞具有相同的染色質(zhì)特征,這一發(fā)現(xiàn)無法通過批量實驗檢測到。這兩類細胞中,均出現(xiàn)染色質(zhì)標記物H3K27me3丟失,H3K27me3與穩(wěn)定的轉(zhuǎn)錄抑制基因有關(guān),已知這些基因可以促進耐藥的發(fā)生。本研究開發(fā)的單細胞染色質(zhì)免疫沉淀后測序的方法為染色質(zhì)異質(zhì)性功能的研究提供了有力工具,可應用于癌癥和其他疾病以及保健的研究,特別是涉及細胞分化和發(fā)育過程的研究。(摘譯自Nature Genetics,Published:31 May 2019)
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