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我國科學(xué)家實現(xiàn)實時超靈敏熒光成像

   2022-10-25 互聯(lián)網(wǎng)綜合消息
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核心提示:生物體的正常運(yùn)作依賴于一系列時空協(xié)調(diào)的細(xì)胞和亞細(xì)胞活動。觀察和記錄這些現(xiàn)象被認(rèn)為是了解它們的第一步。熒光成像的最新進(jìn)展使

生物體的正常運(yùn)作依賴于一系列時空協(xié)調(diào)的細(xì)胞和亞細(xì)胞活動。觀察和記錄這些現(xiàn)象被認(rèn)為是了解它們的第一步。熒光成像的最新進(jìn)展使我們能夠以高分子特異性和高時空分辨率解析生命活動機(jī)制,從納米尺度的細(xì)胞器相互作用,到胚胎發(fā)育過程中的細(xì)胞足跡,再到與特定行為同步的全腦神經(jīng)活動。熒光成像的一個基本挑戰(zhàn)是光子探測不可避免的隨機(jī)性導(dǎo)致的光子散粒噪聲,這是由光的量子本質(zhì)決定的,光子噪聲是前沿科學(xué)觀測中繞不開的障礙。

近期,清華大學(xué)腦與認(rèn)知科學(xué)研究院、自動化系、清華-IDG/麥戈文腦科學(xué)研究院團(tuán)隊在《Nature Biotechnology》雜志發(fā)表了題為“Real-time denoising enables high-sensitivity fluorescence time-lapse imaging beyond the shot-noise limit”的研究論文,實現(xiàn)了實時超靈敏熒光成像。在這項工作中,為了實現(xiàn)超出散粒噪聲限制的高靈敏度熒光成像,提出了DeepCAD-RT:一種用于實時噪聲抑制的自監(jiān)督深度學(xué)習(xí)方法。該方法可以與顯微鏡采集系統(tǒng)結(jié)合以實現(xiàn)實時去噪。這個方法基于深度自監(jiān)督學(xué)習(xí),原始的低信噪比數(shù)據(jù)可以直接用于訓(xùn)練卷積網(wǎng)絡(luò),這使得它在功能成像中特別有優(yōu)勢,因為樣品正在經(jīng)歷快速的動態(tài)變化,而捕捉真實數(shù)據(jù)是很難或不可能的。研究者展示了多種實驗,包括對小鼠、斑馬魚和蒼蠅的鈣成像,細(xì)胞遷移觀察和新型基因編碼ATP傳感器的成像,涵蓋2D單平面成像和3D體積成像。定性和定量評估表明,該方法可以顯著增強(qiáng)熒光延時成像數(shù)據(jù),并允許對超出散粒噪聲限制的生物活動進(jìn)行高靈敏度成像。

作為一種在多種模式動物、多種生命過程上均表現(xiàn)出強(qiáng)大性能的去噪技術(shù),DeepCAD-RT有望應(yīng)用到更多的成像場景中,并推進(jìn)多種成像技術(shù)的發(fā)展。

原文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41587-022-01450-8

注:此研究成果摘自《Nature Biotechnology》雜志,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場,僅供參考。

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