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突變“熱點”揭示癌癥誘發(fā)新因素

   2022-02-10 科技日報
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核心提示:美國加州大學圣地亞哥分校的生物工程師們在最新研究中發(fā)現(xiàn)了癌癥進化中一個此前未被認識到的關鍵角色:基因

美國加州大學圣地亞哥分校的生物工程師們在最新研究中發(fā)現(xiàn)了癌癥進化中一個此前未被認識到的關鍵角色:基因組某些區(qū)域發(fā)生的簇狀突變。研究人員發(fā)現(xiàn),“簇狀體細胞突變”在大約10%的人身上誘發(fā)了癌癥進展,了解它們可以預測患者的存活率。相關論文9日發(fā)表在《自然》網(wǎng)站上。

簇狀意味著它們在細胞基因組的特定區(qū)域聚集在一起,而體細胞意味著它們的遺傳信息不會傳遞給下一代。

該團隊在創(chuàng)建迄今最全面、最詳細的已知簇狀體細胞突變圖時做出了這一發(fā)現(xiàn)。他們首先繪制了2500多名癌癥患者的基因組中的所有突變(簇狀和非簇狀),這項工作總共涵蓋了30種不同的癌癥類型。研究人員使用了人工智能,通過算法來檢測每個患者體內的簇狀突變,并闡明導致此類事件的潛在突變過程。他們發(fā)現(xiàn),在大約10%的人類癌癥中,簇狀體細胞突變有助于癌癥的進化。

研究人員進一步發(fā)現(xiàn),一些癌癥誘發(fā)簇,特別是在已知癌癥誘發(fā)基因中發(fā)現(xiàn)的那些簇,可以用來預測患者的總體存活率。例如,BRAF基因(黑色素瘤中最廣泛觀察到的驅動基因)中簇狀突變的存在可提高患者的總體存活率。然而,EGFR基因(肺癌中最廣泛觀察到的驅動基因)中簇狀突變的存在導致患者存活率下降。

研究人員表示,他們發(fā)現(xiàn)不同的存活率僅僅是在這些基因中檢測到簇狀突變,這在臨床上常用的現(xiàn)有平臺上是可以實現(xiàn)的。因此,這是一個簡單而精確的判斷患者存活率的生物標記物。

研究人員還確定了導致簇狀體細胞突變的各種因素。這些因素包括紫外線輻射、飲酒、吸煙等。

此外,一組名為APOBEC3的抗病毒酶的活性可能會導致這種突變,加速癌癥發(fā)展。研究人員表示,這是一種全新的致癌模式。這為新的治療方法奠定了基礎,臨床醫(yī)生可以考慮限制APOBEC3酶的活性和/或針對染色體外環(huán)狀DNA(ecDNA)來治療癌癥。(實習記者張佳欣)



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